En el Parque Karukinka habita un ensamble único y delicado de especies, algunas migran por Tierra del Fuego y el mar de Patagonia para, volver año a año a reproducirse y mantener el ciclo de la particular ecología del Cono Sur.

WCS Chile protege algunas de estas especies, como guanacos, albatros de ceja negra y elefantes marinos, por medio de la investigación y monitoreo, de la ejecución de acciones de conservación y de la promoción de su valor. 

El huemul también es una especie de interés para WCS Chile. Se encuentra en territorio continental entre las regiones de Aysén y Magallanes en el extenso Parque Nacional Bernardo O’Higgins, donde habita una de las poblaciones más densas de huemules del país.