El parque Karukinka alberga especies y ecosistemas de importancia global y gran valor en biodiversidad. Sus bosques templados, únicos a esta latitud, cubren grandes extensiones del sur de Tierra del Fuego; la estepa o pampa contiene a matorrales achaparrados, adaptados a las condiciones de déficit de humedad; la costa del Parque Karukinka, al norte del Seno del Almirantazgo, es refugio de colonias únicas de aves y mamíferos; las turberas -humedales de turba- secuestran importantes cantidades de carbono y regulan los ciclos hidrológicos: y el ecosistema andino dominado por vegetación herbácea o arbustos adaptados a las bajas temperaturas y el viento, es coronado por los majestuosos cóndores.