La science est la pierre angulaire de l'approche de la WCS en matière de conservation, guidant les politiques et orientant les stratégies de terrain. Chacun des programmes de conservation du paysage Ndoki-Likouala mène différents projets et sites de recherche en fonction des dynamiques locales spécifiques. Au-delà de ces derniers, l'inventaire de Ndoki-Likouala est une vaste opération quinquennale d'inventaire des animaux sauvages sur les 34 000 km² du paysage.